林一二2022年09月04日 14:01
蛋白间相互作用的图谱（Ctsb在cn.string-db.org上的例子）和代码文件间调用关系的图谱（davidmfoley/node-trucker readme 里的例子）都难以帮助了解运行时发生了什么。
以代码来说，我们只能确定入口文件是先被调用的，但是其它文件里的函数和类可能只是初始化了，但是并没有被「激活」，也就是没有实际开始执行和产生输出，只有从入口到代码深处的一条调用链是真正执行了的。而它可能开始了一次对外界的监听，等待某个条件成立后才触发别的文件内函数的实际执行。
这个时间维度在关系图上是缺失的，只有在细节的代码上才能看出来。