Meme of LinOnetwo

Pymol 导出 Alphafold3 预测结果中的结合界面

1. 右上方显示各种 Selection Object， A 里面有各种 action 例如 find 生成新的 Selection Object，；C 里面有染色，例如 by chain 可以把一个 cif 文件里的两条链自动染色
2. select 可以生成 Selection Object 并导出
3. distance 命令可以生成 Distance Object 但无法导出
4. 看界面残基 https://pymolwiki.org/index.php/InterfaceResidues ，保存为py 后 pymol 可以执行它就能调用里面定义的函数了 interfaceResidues("All", cutoff=0.25)
5. 导出 save 拖动文件夹到这里interface.pdb, interface